Ionizační pufry se používají pro potlačení ionizační interference při plamenové AAS. Ionizační pufr se v plameni přednostně ionizuje, zvyšuje tlak volných elektronů a potlačuje tak nežádoucí ionizaci analyzovaného prvku. Jako ionizační pufry se používaj sloučeniny Cs, Li nebo K. Vždy musí platit, že použitý ionizační pufr se musí ionizovat snadněji než stanovovaný prvek.